新疆昌吉国家农业高新技术产业示范区是2022年4月经国务院批准成立的第二批国家级农高区(国函〔2022〕37号)，前身是2002年设立的昌吉国家农业科技园区。总体规划总面积为423平方公里。该园区位于新疆昌吉市，是丝绸之路经济带核心区、国家重点规划的乌昌石城市群和乌克昌片区发展的核心区，距离乌鲁木齐国际机场15公里，高铁23公里，距离中欧班列集结中心12公里，交通地理位置优越。昌吉国家农高区是新疆获批的唯一一家国家级农高区，在全国9家农高区中产值位居第一，曾多次在全国国家级农业科技园区综合评估中名列前茅。

昌吉国家农高区党工委、管委会是昌吉州党委、人民政府派出机构，实行“一个窗口对外、一条龙服务”管理服务机制，打造最优营商环境。通过“管委会+公司”开发建设管理运营机制，农投集团积极通过股权投资、融资担保等市场化方式支持入驻企业，实现高质量发展。昌吉国家农高区与中国农业科学院、中科院新疆分院等20余家科研院校开展深度产学研合作，与中国农业科学院西部农业研究中心一体发展，建设国家农业生物安全科学中心西北中心、国家棉花技术创新中心等20余个国家级创新平台，依托中国农科院中亚农业研究中心，搭建与中亚国家农业科技合作交流平台，推进中国农科院国际教育学院、新疆大学智慧农学院落地，为昌吉国家农高区科研、人才需求提供保障。

昌吉国家农高区围绕生态功能定位，形成“一城一镇两区”产业整体布局结构。规划面积28.3平方公里的商业区域成熟，基础设施配套齐全，公共服务保障完善，重点引进总部经济、现代金融、教育科研、信息产业、商贸物流、创投公司等产业，打造成乌昌地区新商圈和临空经济港。规划面积82平方公里，在加强现有优势主导产业提质增效的基础上，主动承接农科城功能、产业外溢，以“农投公司(资金)+西部中心(技术)+六工镇(空间)”的推进模式，会同昌吉市共同打造乡村产业融合发展样板区。规划面积为64.7平方公里，已实现“十通一平”，具备承载大项目落地的基础和条件。围绕粮油、棉花和纺织服装、绿色有机果蔬、优质畜产品、生物制造和农业装备制造，着力打造“4+2”产业集群。规划面积为248平方公里，打造绿洲农业“综合性公共田间试验平台”和服务新疆农业高质量发展的“第二实验室”，把西部中心试验成功的科技成果进行成熟化推广。